江苏省生信专委会实战培训--非编码RNA专场
生物信息学(Bioinformatics)是目前生命科学和自然科学的重大前沿领域之一,一切都开始进入了大数据时代,研究人员都越来越需要对这些庞大的信息进行收集、整合、处理和诠释。 而研究人员需要面对大量的数据量时,往往不知道从何处理。
为满足越来越多的研究人员对生物信息学的学习要求,江苏省生物医学工程学会生物信息学专业委员会开发一系列生物信息学培训课程,定期举办生物信息学培训班,由专委会知名教授学者授课,理论讲解与上机实践结合。
本期课程开课时间是11月25号至11月26号,南京农科院
主办单位主办:
江苏省生物医学工程学会生物信息学专业委员会
南京农科院种质资源与生物技术研究所(简称资源所
承办:南京蔚然商务咨询有限公司
媒体支持:生信技能树
宋晓峰教授
南京航空航天大学
课程内容
非编码RNA(环形RNA,lincRNA)生物信息学研究策略
真核生物转录组测序数据的生物信息分析及研究策略
环形RNA的检测分析软件及计算方法
LincRNA的生物信息分析及研究策略
非编码RNA常用数据库介绍(上机实战)
常用LincRNA数据库的分析与使用
常用CircRNA数据库的分析与使用
常用miRNA数据库的分析与使用
非编码RNA生物功能研究策略
LincRNA功能研究策略
环形RNA竞争性结合miRNA调控靶基因的研究策略
环形RNA编码蛋白潜能的分析研究策略
生物信息学常用工具介绍(上机实战)
计算机系统Linux介绍
目前大量的生物学问题依赖于高性能计算机的强大计算能力,掌握高性能计算机的常用操作系统linux,是分析生物学大数据的前提和基础。此部分主要介绍和上机熟悉linux的常用命令,以便于开展后续生物信息学工具的使用。
Python语言,R语言介绍
目前大多数生物信息学软件均由Python编写完成,熟悉Python语言对理解生物信息学软件工具具有重要作用。R语言作为生物统计和图表绘制常用语言,也是生物信息学研究必须掌握的语言。此部分主要介绍和上机熟悉Python语言,R语言基础部分,达到理解其在生物信息学领域使用的基本目的。
基因组浏览器IGV使用与介绍
IGV是一种高性能的基因组可视化工具,用来交互式地展示基因组以及转录组测序比对数据。此部分主要介绍和上机熟悉IGV的下载,安装,使用过程中的常见问题。
部分合作教授
孙啸
目前任东南大学生物科学与医学工程学院教授,江苏省生物医学工程学会生物信息学专业委员会主任。
主要从事生物信息学研究,包括基因组信息分析、基因表达调控信息分析、生物分子序列特征研究、生物医学文献挖掘等。承担过多个国家自然科学基金、国家863 计划以及省部级科研项目,主持研制出“分子电子学虚拟信息服务系统”、“高密度基因芯片设计”、“基因调控信息集成数据库系统”、“基因组序列特征分析”等多个软件系统。在《Bioinformatics》。获得软件著作权3项。在国内最早开设生物信息学研究生课程,培养该领域高水平人才。主编出版生物信息学教材1部,翻译出版教材1部。曾经获得江苏省优秀研究生指导教师称号。
马飞
现为南京师范大学生命科学院教授。任江苏省动物学会理事,江苏省生物医学工程学会生物信息学专业委员会成员,美国遗传学会会员。已主持国家自然科学基金、教育部“新世纪优秀人才支持计划”、863计划专题、973计划子课题以及国家转基因生物新品种培育重大科技专项子课题10余项。在Molecular Biology and Evolution, Bioinformatics, BMC EvolutionaryBiology, FEBS Letters, Developmental & Comparative Immunology, Fish &Shellfish Immunology, Mutation Research等国际重要学术刊物上发表SCI收录论文50余篇。参编学术著作和教材三部。获省部级自然科学和科技进步奖各一项。已申请国家发明专利1项。
姜勇
先后主持国家杰出青年科学基金,国家“973”科技计划项目、国家自然科学基金重点项目和国家“863”计划课题等20多项。获军队科技进步一等奖1项,二等奖2项;国家科技进步三等奖1项;国家发明四等奖1项,广东省科学技术奖励一等奖1项。曾获第六届“中国青年科技奖”;还担任了《SHOCK》、《PLOS One》、《Mediatorsof Inflammation》等国际SCI期刊的编委或学术编辑。是国家“973”计划项目首席科学家,教育部“长江学者”特聘教授,国家杰出青年科学基金获得者、首批新世纪百千万人才工程国家级人选以及首批广东特支计划百千万工程领军人才。
往期课程精彩回顾
学员们在助教的辅助下开始认真准备
数据库与数据挖掘及软件使用的讲解
分子进化速率的计算及其应用 -- 杜建厂教授
生物医学大数据融合分析及知识挖掘 -- 孙啸教授
当然最后一定还有讲师和学员的合影
课程费用
报名人数满20人开班
培训费:2600元/人(费用包括午餐,住宿费自理)
1. 三人组团报名,每人可优惠150元
2. 五人组团参会,每人优惠300元
本次会议可以开正规会务发票,纸质邀请函。
再次强调,点击下面的阅读原文进行报名,报名成功确定去参加培训的请务必联系我哈,我会在南京请大家吃饭。